"House of the Dragon", Targaryen ailesinin hikayesini, özellikle de Targaryenlerin Westeros'taki taht mücadelesini ve Ejderhalarla olan bağlarını konu alır. Dizi, Targaryenlerin Egemenliği'nin zirveye ulaşmasından sonra, taht için iç savaşa ve tahtın mirasçısı olma mücadelesine odaklanır. Bu iç savaş, tarihte "Dance of the Dragons" (Ejderhaların Dansı) olarak bilinen, Targaryen ailesi içindeki kanlı ve yıkıcı bir iç savaşla şekillenir.