Köstebekya’da doğa büyük bir tehdit altındadır. Toprağı verimli kılan ata tohumları, gizemli bir düşman tarafından çalınmıştır. Bu tohumlar olmadan hem Köstebekya'nın hem de insanların dünyasının geleceği tehlikededir. Kahramanlarımız Köstebekgiller, yardım için yeniden Deniz ve Arda’ya başvurur.Deniz, Arda ve sevimli dostları; doğayı korumak, geleneksel tarımı yaşatmak ve kötü planları durdurmak için zorlu bir maceraya atılır. Tohumların izini sürerken hem doğayla hem de kendi cesaretleriyle yüzleşmek zorunda kalırlar.